京都府京都市左京区鞍馬本町にある神社。祭神は大己貴命(おおなむちのみこと)と少彦名命(すくなひこなのみこと)で医薬の祖神。天慶3年（940年）に平安京北方守護のために創建された。交通安全、縁結び、子授け、安産、火難除けなどのご利益があるとされ、信仰を集める。10月22日には由岐神社の例祭である京都三大奇祭のひとつ、「鞍馬の火祭」が行われる。